במזגן מצטברים עובש, פטריות וחיידקים אשר גורמים לתגובות אלרגיות, אוויר מזוהם ולפעמים אף ריח רע. המזגן הוא מקום נוח להתפתחות עובש וחיידקים הפוגעים בדרכי הנשימה.

המזגן הוא מקום לח וחשוך ומתקיימים בו תנאים אופטימליים להצטברות עובש פטריות וחיידקים, הגורמים לתגובות אלרגיות, ריח רע ואף להפצת אוויר מזוהם העלול לפגוע בדרכי הנשימה.

ניתן למנוע זאת על ידי ניקוי וחיטוי המזגן על מנת שיישאר נקי וידידותי לאורך זמן